激光脫毛的原理仍然是基於選擇性光熱作用熱蠟除毛理論。毛囊和毛干中有豐富的黑色素，黑色素分布於毛球基質的細胞之間，並且也能向毛干的結構中轉移(如髓質、皮質和毛小皮)。激光能以黑色素為靶目標精確而選擇性地進行脫毛治療。黑色素在吸收了激光的能量後，溫度急劇升高，從而導致周圍毛囊組織的破壞，將毛發去除。
根據選擇性光熱作用理論，只要選擇合適的波長、脈寬和能量密度，激光就能精確地破壞毛囊而不引起鄰近組織的損傷。為了達到療效，蜜蠟除毛很明顯毛球和其上方的隆突部(位於皮脂腺開口與立毛肌毛囊附著處之間的毛囊外根鞘，該處是毛囊干細胞所在的部位)的黑素都必須受到光照治療。
①由於毛球除毛教學部位較深，決定了要使用波長較長、穿透較深的光源進行治療。另一方面，如果波長太短，表皮的黑色素會與毛囊的黑色素競爭性吸收較多能量，因而易引起表皮損傷。所以，在保證光波對黑素有較好吸收的同時，脫毛激光的波長以695-1064 nm為佳。
②要取得對毛囊破壞的較高效率的一個解決方法顯然是增加激光的照射時間。理論上講，通過加長激光脈寬，接近毛囊的熱弛豫時間可提高療效，脈寬越長，表皮中的微小結構如黑素小體損傷的可能性就越小，而相對巴西除毛較大的結構如有色毛囊，其內黑素就越易受損傷。毛囊的直徑約為200-300μm，毛囊的熱弛豫時間為40-100ms。
因此，理想的激光比基尼除毛脈寬應該在幾十毫秒至100毫秒之間。最近的研究發現對於深色皮膚的患者采用脈寬超過100ms的激光器，不但有更好的療效且副作用較少。
毛發的生長周期和脫毛治療的關系：
①因激光對退行期、靜止期的毛發無明顯作用，只有等這些毛發轉入生長期後激光才能起作用，所以激光脫毛需要多次治療，效果才能明顯。
②如某部位毛發處於生長期的比例小，則治療次數要增多。反之治療次數可減少。
③基於不同部位的毛發有不同的生長周期，每次治療間隔也有差異。如頭部毛發有相對較短的靜止期，故間隔時間可短至l月；軀干和四肢毛發靜止期相對較長，因此治療間隔以2月左右為宜。
④毛囊的深度也因部位而異，如深度較深須采用較長波長的激光治療，反之如深度較淺可采用較短波長的激光治療。
⑤如某一部位的毛囊密度過高，則治療時應適當減少激光能量。
